تاریخ اجرای طرح پژوهشی از زمان عقد قرارداد است.

مجری اصلی موظف است حداکثر تا زمان ارائه شده در پروپوزال (جدول گانت)، به انجام طرح و ارائه مستندات گزارش نهایی و مقالات مستخرج از آن مبادرت ورزد. این زمان به درخواست مجری و با ارائه مستندات قابل قبول برای شورای تحقیقات و فناوری حداکثر تا دو بار قابل تمدید است.

در صورتی که در زمان مقرر (جدول گانت) گزارش نهایی برای طرح تحقیقاتی ارائه نشود طرح به عنوان طرح فسخ قرارداد در نظر گرفته شده و مجری موظف است هزینه‌های اولیه (وسائل و مواد درخواستی) دریافت شده را به قیمت روز به دانشگاه بازگرداند.

پرداخت هزینه‌های وسائل و مواد درخواستی و همچنین هزینه‌های آزمایشات و خدمات تخصصی در هنگام عقد قرارداد و به صورت کامل (100 درصد) به محقق پرداخت می‌شود.

برای طرح‌های تحقیقاتی که آزمایشگاهی نبوده و فقط هزینه پرسنلی دارند (با سقف 80 میلیون ریال) علاوه بر بروندادهای ترجمان دانش شامل نشست خبری، ترجمان دانش، پادکست و پیام پژوهشی در صورتی که یک مقاله ارائه داده شود کل هزینه و در غیر اینصورت 25 درصد حق الزحمه پرسنلی به محقق پرداخت می‌شود.

سقف هزینه پرسنلی در هر طرح تحقیقاتی 30 تا 80 میلیون ریال (بر اساس نظر شورای پژوهشی) است.