در حال حاضر دو دوره برنامه دکتری تخصصی پژوهشی و پزشک پژوهشگر در معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه علوم پزشکی اراک وجود دارد که به شرح هر کدام پرداخته می شود.